Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Limd1Q9QXD8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Limd1Q9QXD8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Limd1Q9QXD8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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