Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim44Q9QXA7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms