Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptf1aQ9QX98 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptf1aQ9QX98 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms