Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms