Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms