Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms