Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms