Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms