Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tlr5Q9JLF7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms