Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp5Q9JKD3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms