Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uchl3Q9JKB1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms