Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pard6bQ9JK83 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms