Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msgn1Q9JK54 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msgn1Q9JK54 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms