Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnga3Q9JJZ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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