Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms