Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd3Q9JJY3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd3Q9JJY3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms