Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms