Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms