Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms