Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb1Q9JIF7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb1Q9JIF7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms