Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl1Q9JI74 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl1Q9JI74 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms