Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pus3Q9JI38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pus3Q9JI38 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms