Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms