Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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