Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms