Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms