Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scn4aQ9ER60 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms