Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms