Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms