Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rapgef4Q9EQZ6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms