Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms