Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rhox9Q9EQM5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rhox9Q9EQM5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rhox9Q9EQM5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rhox9Q9EQM5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rhox9Q9EQM5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rhox9Q9EQM5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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