Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlr1Q9EPQ1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms