Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SyncQ9EPM5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms