Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms