Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hmg20aQ9DC33 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hmg20aQ9DC33 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hmg20aQ9DC33 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hmg20aQ9DC33 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hmg20aQ9DC33 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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