Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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