Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc46a3Q9DC26 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc46a3Q9DC26 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms