Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf6Q9DBU5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms