Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms