Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5oQ9DB20 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5oQ9DB20 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms