Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Asf1bQ9DAP7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Asf1bQ9DAP7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms