Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph3bQ9DA80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms