Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms