Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms