Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms