Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms