Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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