Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms