Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp2c55Q9D816 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms